話說皇後襬完壽宴後，各藩王都心懷不軌。因爲知道明太祖不久於人世了，這天皇上早朝後，召見燕王到御書房見面。只聽皇上對燕王說：“燕王，你是我衆多兒子中最有能力的一個。”燕王說：“那皇位繼承人是不是就是我？”明太祖說：“雖然你能力強，但是朱允蚊畢竟是大兒子的兒子，理應繼承皇位。而且他性格溫順，做了皇太孫那麼久了。你明白嗎？”燕王說：“爲什麼會這樣，我什麼都比他強。”明太祖說：“你不用多說了。多說也沒用。”燕王說：“好，既然你這樣。以後有什麼事情發生，你自己負責。”說完，怒氣衝衝離開了。而明太祖就坐在龍椅上氣得出不了聲。
就在明太祖駕崩前，他自己祕密寫了遺詔，上面寫着誰是繼承皇位者。交給龍華寺的方丈保管。1398年6月24日，71歲的朱元璋駕崩，葬於孝陵，諡號“聖神文武欽明應運俊德成功統天大孝高皇帝”，廟號“太祖”。在明太祖駕崩時，各王都想做反。各藩王都以燕王馬首是瞻。但燕王老謀深算，壓制着各王的野心。同時當時遺詔不見了，各王都想立燕王朱棣爲皇，但朱棣說：“現在先皇剛駕崩，而且遺詔還沒找到。不如找到遺詔後再說吧，衆臣都無異議。於是皇太孫朱允蚊就派錦衣衛盧亮鋒，燕王朱棣就派馬三保兩人共同偵查遺詔下落。